Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00312Q9Y6C7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms