Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AFG3L2Q9Y4W6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms