Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms