Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q9Y3F1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9Y3F1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms