Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDGFL3Q9Y3E1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms