Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CAB39Q9Y376 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms