Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms