Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDZRN3Q9UPQ7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN3Q9UPQ7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms