Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSR3Q9UNL2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms