Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP18Q9UMW8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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