Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms