Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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