Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms