Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms