Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EPHA6Q9UF33 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms