Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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