Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXTL2Q9UBQ6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms