Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SH3BP4Q9P0V3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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