Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDL2Q9NX52 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms