Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJC28Q9NX36 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJC28Q9NX36 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms