Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms