Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWN3

FBXO34, F-box only protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO34Q9NWN3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO34Q9NWN3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms