Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms