Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRD7Q9NPI1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms