Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK-5Q9HDB9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms