Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms