Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIFKQ9BYG3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms