Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTRT3Q9BYD9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms