Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms