Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT27Q9BW83 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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