Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KATNB1Q9BVA0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms