Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms