Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MESP1Q9BRJ9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MESP1Q9BRJ9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms