Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPS6KC1Q96S38 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms