Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC38A2Q96QD8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms