Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms