Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BORCS6Q96GS4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms