Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms