Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms