Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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