Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms