Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HPS3Q969F9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HPS3Q969F9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms