Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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GTF3C6Q969F1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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GTF3C6Q969F1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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GTF3C6Q969F1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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GTF3C6Q969F1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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GTF3C6Q969F1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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GTF3C6Q969F1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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GTF3C6Q969F1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C6Q969F1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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