Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms