Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms