Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TTC21AQ8NDW8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC21AQ8NDW8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms