Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms