Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms