Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMCO5AQ8N6Q1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMCO5AQ8N6Q1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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