Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFRP1Q8N474 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms